行政院吳院長於99年3月17日下午5時30分與中科廠商座談，本次座談會園區廠商踴躍建言，院長最後再次對園區廠商對國家經濟的重要貢獻，表示誠摯的敬佩與謝意。在金融海嘯最嚴重時園區廠商被迫以員工休無薪假來因應，政府也以調降管理費協助園區廠商度過金融海嘯的衝擊，所幸經由大家的努力，景氣已好轉，目前中科已無休無薪假人員，再次感謝大家的努力。會中所提建議，將請相關部會協商研擬解決方案及配套措施，並持續追蹤檢討，期望與諸位先進攜手努力，共同將面臨的問題一一克服、突破。
座談會中園區廠商提問11個相關園區管理政策提案，經由各部會代表說明後，院長綜合裁示摘要如下：
一、簽署「兩岸經濟合作架構協議(ECFA)」乙項：推動本案整體利益大於衝擊，經濟成長率可望將提高1.65%～1.72%，總就業人數也可望淨增加25.7萬人～26.3萬人。行政部門將持續透過各種管道，與社會各界進行溝通及說明。
二、建請財政部及國稅局，對廠商研發抵減之認定，召開說明會並訂定研發抵減之法規依據乙項：未來宜強化研發支出適用投資抵減疑義案件之專業意見諮詢制度，並請各地區國稅局加強研發投資抵減辦法之教育宣導。
三、中科后里園區配套基礎建設改善乙項：中科「新闢南向聯外道路工程」為臺中縣政府承諾園區開發之辦理事項，宜由臺中縣政府評估園區開發交通需求持續推動。后里鄉排水部分，請經濟部水利署儘速邀集相關單位現勘瞭解實情，協助改善。
四、為響應 馬總統愛台十二建設之中部地區物流需求，台中機場“等待”政府支持核准設立航空貨物集散站乙項：本案將請民航局先行評估，倘具推動可行性，則請加速辦理航空貨物集散站經營業管理規則之修訂作業，以協助業者設置臺中機場航空貨物集散站。
五、牛樟芝為台灣特有國寶級藥用真菌，希望政府單位建立牛樟芝特有指標成分，並作為標準品以供業者比對乙項：請衛生署儘速與經濟部標準檢驗局等相關單位研議訂定「牛樟芝」國家標準，作為業者鑑別牛樟芝品質真偽之依據，以利生技產業發展。
六、建議太陽能產業使用的TCO玻璃、素玻璃、強化玻璃全面開放進口乙項：「TCO玻璃」已公告開放准許自大陸進口至100年3月31日止，期限屆滿將再作檢討。至「素玻璃」及「強化玻璃」2項，目前國內已有產製且供應充足，不符「台灣地區與大陸地區貿易許可辦法」開放之條件，現階段暫不宜開放自大陸進口。
七、政府機關及國營事業單位應由政府設定綠色能源建置目標，引領民間參與，起帶頭作用乙項：請經濟部加強向企業與民眾宣導當前節能減碳與再生能源政策，鼓勵各界與政府一同投入節能減碳相關措施與設置再生能源發電設備。
八、2009年因世界性的經濟風暴後續衍生問題乙項：政府將持續加強推動並落實「三挺政策」各項措施，且密切掌握國內經濟狀況及金融市場變動情形，積極推動金融機構協助營運正常企業穩定經營資金之相關措施，以協助國內企業渡過困境。
九、對LED上游產業採行相關補助措施，以使廠商根留台灣乙項：目前LED產業已為行政院推動之六大新興產業中重要之綠色能源產業，請經濟部依「綠色能源產業旭升方案」及其行動計畫積極推動，協助該產業之發展。
十、建請政府與立法部門協調儘速通過產業創新條例立法乙項：「產業創新條例」是接續促進產業升級條例落日之重大經濟法案，攸關我國整體產業經濟發展，已列為立法院本會期第一優先處理法案。將積極協調立法院於本會期儘速立法通過，促使政府各項政策得以落實推動。
十一、建請勞委會暫緩實施於98年12月9日預告修正「勞工健康保護規則」，其中刪除原法規第四條有關聯合設置醫療單位部分乙項：園區聯合診所係依醫療法設置，不因勞委會健康保護規則修正而廢除，仍可持續提供原醫療及緊急救護業務。
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